辣椒植株的任何部位都会感病,幼苗期,成株的叶片、茎部、果实均可受害。幼苗发病,茎基部呈水渍状软腐,其上部呈暗绿色而倒伏;叶片发病,病斑暗绿色,迅速扩大,使叶片一部分或大部分软腐,干燥后病斑变为淡褐色;茎部受害,病状与叶上相似,常易从病部折断;果实受害,病斑呈暗绿色水渍状而软腐,干燥后变成淡褐色而枯缩。苗期发病首先会在茎基部形成暗绿色的水渍状病斑,之后植株会迅速地因褐腐缢缩而猝倒,有时茎基部会呈黑褐色,严重时幼苗会枯萎死亡;成株期若叶片感病则会出现病斑,病斑呈圆形或近圆形,边缘为黄绿色,中央为暗褐色;椒果发病多从蒂部开始,病斑为水渍状,暗绿色,扩大后可遍及整个椒果,潮湿时椒果表面会产生霉层。