大豆病虫危害应遵循预防为主，综合防治的原则。防治方法包括农业防治和化学防治。首先，加强肥水管理，增加抗性，并加强巡查，发现病虫害达到防治指标时对症选药精准喷雾防治。
大豆霜霉病防治：1.农业防治，选用抗病品种，精选种子，汰除病粒，实行2-3年轮作。2.药剂防治，使用40%乙磷铝可湿性粉剂。
大豆灰霉病防治：1.亩用50%多菌灵可湿性粉剂100克；2.每亩用40%多菌灵胶悬剂100克。
大豆灰斑病防治：1.苗期较湿润多雨的地区，用50%福美双或50%多菌灵拌种，每100公斤种子用药0.3公斤；2.针对感病品种，生长茂密的豆田，于发病初期或荚和籽粒易感病期喷药，以控制籽粒上的病斑。