青霉素为首选药，用量和疗程依每只羊的病情轻重而定。每天静脉用药100万IU～200万IU。在清除病灶、引流或切开排脓前二三天开始用药，术后再用药三四天。为促进青霉素渗入病灶处，可加用10%碘化钾溶液10毫升～20毫升口服，每天一二次。患部可用碘酒涂抹，也可将2克碘化钾溶于1毫升蒸馏水中与5%碘酒混合，一次注射于患部。为加强青霉素疗效，可与磺胺药物并用，磺胺药物每日一二克口服。当青霉素无效时，可选用红霉素、四环素、林可霉素、头孢菌素和利福平等广谱抗菌药物。
羊放线杆菌病的治疗：静脉注射10%碘化钠溶液20-25毫升，每周1次，并常给患部涂抹碘酒，直到痊愈为止。因该病侵害软组织，故使用静脉注射比较有效。内服碘化钾，每次1-1.5克，每天3次，直到肿胀完全消失。