蚊蝇可以传播疾病，防治办法包括减少养殖场周边蚊蝇滋生环境、使用化学药剂杀灭以及圈舍加装纱窗阻隔蚊蝇进入。苍蝇在取食时有呕吐和排便的习性，蚊子会传播疾病，因此养殖场需做好场内外的环境卫生，清除蚊蝇的滋生场所。蚊子的幼虫生活在水中，清除住宅内外的积水是灭蚊的根本措施。
防治方法具体如下：
1.空间喷洒：用喷雾器对场区、圈舍等环境进行喷撒消毒，可快速消灭成蝇。
2.滞留喷洒：用类似油剂的药剂喷洒圈舍的卧床、粪道、地面、墙壁以及生产区，持续时间长，灭蝇效果显著。喷洒时间、湿度及稀释剂量需注意，一般早晨6-7点和下午5-7点效果更佳。
3.投饵料：将饵料颗粒撒在生活区、养殖区、产房、粪池周边等成蝇较多的地方，或涂抹到粪池墙体上。外界温度达到13-20℃时，蝇卵集中，灭蝇效果较好。
蚊蝇不仅刺吸畜禽血液、传播疾病，还骚扰畜禽，影响生产、降低产奶率，并对附近生活区的工作人员造成威胁。