红火蚁最怕的农药有多杀霉素饵剂、吡丙醚饵剂、氟虫腈饵剂、甲萘威可湿性粉剂，这些药剂都可以有效防治红火蚁。此外，红火蚁还怕寄生蝇和黄蜻。寄生蝇通过在红火蚁体内产卵导致其机体衰弱直接死亡，而黄蜻是红火蚁的天敌，尤其在春季降雨天气后捕食红火蚁的效率较高。
防治红火蚁的物理方法包括用开水浇湿蚁丘表面，再用铲子挖开土壤并持续浇水，5-10天即可较好控制红火蚁种群。另一种方法是用木棍敲击蚁丘，将红火蚁赶出后，用喷枪火烧蚁丘表面，或直接在蚁丘表面洒可燃液体点燃。但需注意，火烧可能引发红火蚁激烈反应，攻击烧火人员，并可能导致红火蚁向外扩张，形成新的群体。