人参黑斑病的防治方法包括种苗处理、加强田间管理和药剂防治。种苗处理时，可用1%福尔马林浸种10-15分钟，冲洗后晾干催芽播种。参苗出土后，可喷洒代森锰锌1000倍液或多抗霉素200x10-6，每隔10-15天进行1次，雨季可多喷几次。加强田间管理时，及时处理病枝、病叶和病果，秋后收集残枝败叶烧毁，杜绝越冬菌源。药剂防治一般在6月初进行第1次喷药，每隔7-10天喷1次，常用药剂有1：1：160波尔多液、50%代森锰锌500-800倍液、代森铵800-1000倍液及多抗霉素100-150x10等。
此外，选择无病种子，保持参畦卫生，发现病株立即拔除，消灭和封锁发病中心。种子处理时，在催芽或播种前进行种子消毒，以防种子带菌传染，一般使用多抗霉素150单位浸种24小时，50%咪唑霉400倍液浸种2小时，取出阴干后播种。土壤处理时，播种前用70%代森锌7〜8克与半干的细土13〜15千克拌匀，做成1米2的盖土，当人参出苗前，畦面喷施1%硫酸铜溶液或100〜160倍波尔多液，进行畦面消毒。
建立种子田，选留无病种子。播种前用50%代森锰锌1000倍液浸泡24小时，或按种子重量0.3-0.5%拌种。秋季清除病残体。早春用100倍的硫酸铜溶液对参畦、作业道及参棚进行全面消毒。选择地势高、排水性好的地块栽参，床面最好用落叶盖采光要合理。夏季要采取防雨和避强光措施。人参出苗展叶初期开始喷药防治，可选用50%代森锰锌600倍液、50%扑海因1500倍液或1：1：120波尔多液等药剂，每隔7-10天喷药1次，视病情喷5-8次，每次大雨后需补喷。