黄瓜黑星病是一种真菌性病害，病原在病残体上或附着在架材上越冬，借风雨在田间传播，靠气流、雨水、灌水或农事操作等传播，进行再侵染。该病害发生要求低温高湿条件，棚内最低温度为10摄氏度，相对湿度从下午6时到次日10时均高于90%，棚顶及植株叶面结露，是该病发生和流行的重要条件。病菌主要从叶片、果实、茎蔓的表皮直接穿透，或从气孔和伤口侵入。潜育期随温度而异，一般棚室为3〜6天，露地为9~10天。种植密度大，光照少，通风不良，保护地大灌水，重茬地，肥料少等情况下，发病重。
病菌以菌丝体或丝块随残体在土壤中越冬，也可以分生孢子附着在种子表面或菌丝潜伏在种皮内越冬，也可以黏附在棚室墙壁缝隙或支架上越冬。播种带菌种子，病菌可直接侵染幼苗。土壤中病残体上病菌第二年产生分生孢子，侵染定植的瓜苗。田间植株发病后，在适宜条件下病部产生大量分生孢子，分生孢子借气流、雨水和农事操作传播。温、湿度条件适宜时，分生袍子很快萌发，从伤口、气孔或直接穿透表皮侵入。夏、秋气温较低、湿度大或连阴多雨，或菜地浇水过多、栽植过密、连作均有利于该病的发生。
黄瓜黑星病主要危害叶片、茎和果实的幼嫩部分，苗期至成株期均可染病。幼苗染病后，子叶产生黄白色近圆形的小斑点，病斑扩展后相互连接成不规则形的坏死斑，新叶枯萎，植株停止生长；嫩茎染病后，先呈现水渍状浅绿色的椭圆形或不规则的条斑，继而病斑凹陷龟裂呈暗褐色，严重时病部腐烂，湿度大时病斑上长出灰黑色霉层，后期病斑呈星状多边形，病部组织脱落，周围健部继续生长，留下黑色边缘的星状孔；叶柄和瓜蔓被害后，病斑呈菱形或长条形、大小不等、浅黄褐色，病部中间凹陷，纵裂较深，形成疮痂斑；瓜条染病后，开始产生近圆形暗绿色病斑，分泌乳白色胶粒，后逐渐变成琥珀色，干硬后脱落，当病部中间呈疮痂状开裂并凹陷时，病斑停止扩展。感染黑星病的黄瓜瓜条弯曲，潮湿时病部产生黑色霉层。