遇到连续的阴雨天时，玉米锈病容易出现爆发的态势（病菌会在20-30℃的温度范围内向外扩散），在温度较低、经常降雨、湿度较高的地方，玉米锈病更容易发生和流行。当种植密度较大、田间通风透光不良时，一旦过于潮湿病菌便会通过玉米的呼吸孔侵入内部，弱株染病后会向外扩散，直至感染整个种植田。
选择抗病品种作为种植对象，合理密植，适当早播。增施磷钾肥，避免偏施氮肥。下雨后要排渍降湿，并喷施叶面营养剂。孢子发生高峰期，喷施97%敌锈纳原药250-350倍液，或者是50%退菌特可湿性粉剂800倍液。喷施75%肟菌酯·戊唑醇，或17%唑醚·氟环唑，或40%唑醚·戊唑醇等药物，用植保无人机进行均匀喷雾，药液中可添加99%磷酸二氢钾。发病初期，喷施25%三唑酮可湿性粉剂1500-2000倍液，或50%多菌灵可湿性粉剂500-1000倍液，或20%萎锈灵乳油400倍液，或40%福星乳剂9000倍液，每隔7-10天喷1次，连喷2-3次即可。