主要病害包括病毒病、疫病、炭疽病、疮痂病、细菌性叶斑病、根腐病以及生理性病害。主要虫害有茶黄螨、蚜虫、白粉虱、烟青虫、斑潜蝇等。青椒常遭受的病害有疫病、炭疽病、疮痂病、病毒病，虫害则主要是蚜虫和烟青虫。
