治疗时可用磺胺二甲嘧啶、磺胺间甲氧嘧啶钠、氨丙啉等药物进行治疗。
治疗该病可用特痢康0.1—0.15ml/公斤体重，对病猪进行肌注治疗，每天1次，连用3-5天。
仔猪球虫性腹泻病治疗方案是用磺胺嘧啶类药物十止泻因子、收敛等。
