禽流感的潜伏期一般为1-3天，通常在7天以内。一般是急性起病，早期表现类似普通型流感，主要为发热，体温大多持续在38.5℃以上，热程1-7天，多为3-4天，伴有流涕、鼻塞、咽痛、咳嗽、头痛和全身不适。常在发病1-5天后，出现呼吸急促以及明显的肺炎表现。部分患者可以有恶心、腹痛、腹泻、稀水样便等消化道症状。重型患者病情发展迅速，发病1周内很快进展为呼吸窘迫，肺部有实变体征，随即发展为呼吸衰竭，即使接受辅助通气治疗，大多数病例仍然死亡。大多数H7N7毒株感染者以结膜炎为主要表现。
禽流感早期的临床表现和普通流感极为相似，可以出现全身中毒样症状，比如怕冷、发烧、咳嗽（主要以干咳为主，痰量较少）、咽喉疼痛、头晕、头痛、全身肌肉关节酸痛等。部分患者还可以出现消化系统症状，比如腹痛、腹胀、恶心、反酸、呕吐、排稀水样便等。
禽流感主要通过消化道和呼吸道感染，临床表现有多种类型，有的呈致死率较低的呼吸道感染，有的则呈致死率很高的急性出血性感染。目前流感的毒型为温和型。在寒冷冬季，养殖户一定要提早做好预防工作，谨防此病的发生。
禽流感的主要症状为发热，体温大多在39℃以上，常常伴有鼻塞、流涕、咳嗽、咽痛、肌肉酸痛、全身不适等症状，部分病人还可以出现恶心、呕吐、腹痛、腹泻等消化系统症状。严重的会在一周后出现呼吸窘迫而造成呼吸衰竭，更严重的可以出现肺部的实变、胸腔积液、出血等一系列严重呼吸道临床表现。
禽流感的临床症状还包括急性发病死亡或不明原因死亡，从几小时到数天，脚鳞出血，鸡冠出血或发绀，头部和面部水肿。鸭鹅等水禽可见神经和腹泻，产蛋突然下降。感染禽流感以后，主要表现为高热、咳嗽、流涕、肌肉酸痛等，多数伴有严重肺炎，严重情况会因心脏、肾脏等多种脏器衰竭导致死亡。