表现肠管粗大，肠粘膜上有大量的出血点，肠管中有大量的带有脱落的肠上皮细胞的紫黑色血液。
病鸡消瘦，鸡冠与粘膜:，内脏变化主要发生在肠管，病变部位和程度与球虫的种别有关。
1、柔嫩艾美尔球虫主要侵害盲肠，表现为盲肠两侧明显肿胀(较正常的肿大3-5倍)，肠道粘膜出血呈棕红色或暗红色，肠粘膜脱落，肠内有凝血块或黄白色干酪样坏死物。2、巨型和毒害艾美尔球虫侵害小肠中段，表现为肠管扩张，肠壁松弛增厚，有严重的坏死灶，肠粘膜有少量小出血点和白色斑点相间，肠腔有凝血，浆膜淡红色。3、堆型艾美尔球虫表现为十二指肠肿大明显，肠粘膜出血，浆膜可见灰白色小斑点。4、布氏艾美尔球虫侵害小肠后段与盲肠联合部位，表现为上皮细胞脱落，粘膜出血，有针尖状出血及灰白色斑点。
病鸡消瘦，鸡冠与粘膜苍白，内脏变化主要发生在肠管，病变部位和程度与球虫的种别有关。
本病主要病变在消化道，并随球虫种类和寄生部位的不同而有别。侵害盲肠的脆弱艾美耳球虫（或柔嫩型艾美耳球虫），引起盲肠肿大，肠襞增厚，内容物主要为血液或凝血块，时间稍长变成凝固的栓状物，堵塞在肠腔里面。
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