稻田养鱼对养殖鱼类的防病具有重要意义，尤其对多病难养的草鱼意义更大。稻田环境为草鱼提供了良好的生活环境。草鱼在稻田这块透明浅薄的水层中，吃食丰富而新鲜的活饵料；水稻吸收肥料，净化水质，加上稻田灌水，使水质得到更新，有机质含量低，溶氧较稳定；放鱼密度较稀（每平方米最多放2尾）。草鱼生活在这种自然环境中，病原体相互感染的机会较少，因而体质健壮，抗病力强。稻田中所养的草鱼种即使带有病毒，发病率也只有3%，死亡率为2%，而池塘养草鱼种发病率高达85%，死亡率为75%。在一般情况下，池塘细菌数为稻田的2.6倍。
稻田养鱼，一水两用，一水双赢，不与人争粮，不与粮争地。鱼可吃杂草和虫子，减少农药使用，鱼的粪便可以作为肥料，减少施肥，提高地力，使水稻品质提升，不但增产10%，销售价也比单种水稻有所提升。