防制措施包括计划性驱虫、放牧和饮水卫生、加强粪便管理。计划性驱虫可根据当地的流行病学资料作出规划，一般春秋季各进行一次驱虫。放牧和饮水卫生方面，应避免在低湿的地方放牧，不要在清晨、傍晚或雨后放牧，尽量避开幼虫活动的时间，以减少感染机会；禁饮低洼地区的积水或死水。加强粪便管理，将粪便集中在适当地点进行生物热处理，消灭虫卵和幼虫。平时要注重驱虫，定期给予驱虫药，饮水喂料要洁净，少去动物粪便的地方放牧。
羊消化道线虫病的发病原因是：消化线虫主要寄生在羊的肠胃里，刺激肠胃粘膜，造成粘膜损伤，从而导致不同程度的炎症和出血；有些虫体本身可以分泌一些特殊的毒素，导致血液凝固不良，导致大量出血，尤其是扭转血矛线虫；有些虫体可以分泌一些毒素，羊吸收后可以诱发溶血和血液再生；有些虫体分泌的毒素可以影响肠胃蠕动和消化液分泌，导致肠胃消化吸收障碍，导致宿主羊只表现出营养不良等症状。