目前兔疫苗重点预防的疾病有兔瘟、巴氏杆菌病、波氏杆菌病、魏氏梭菌病、大肠杆菌病和葡萄球菌病。兔瘟是传染病，家养宠物兔一般无需接种，正规宠物兔场会在兔子45日龄时注射一次。巴氏杆菌疫苗预防效果一般，免疫有效率约80%，不建议单独接种。波氏杆菌病常与巴氏杆菌病混合感染，单独接种意义不大，但巴波二联疫苗对呼吸道疾病有一定预防效果。魏氏梭菌单联疫苗预防效果良好，但宠物兔患病较少，通常因食物问题或天气突变引发应激反应导致。葡萄球菌疫苗预防效果较好。
兔子需要注射的疫苗包括：兔瘟疫苗颈部皮下注射，巴氏杆菌苗肌肉或皮下注射，波士杆菌苗肌肉或皮下注射，魏氏梭菌苗肌肉或皮下注射，大肠杆菌苗肌肉注射，葡萄球菌苗皮下注射。