对发病仔猪在饲料中加入盐类泻剂连用2天，然后采用综合、对症疗法。病初使用亚硒酸钠、维生素E及对症治疗，有一定效果。本病与应激因素密切相关，如气温突变、仔猪断奶、饲料突然改变，导致胃肠机能紊乱，致病性大肠杆菌异常繁殖，产生大量毒素，再加上寒冷刺激，机体抵抗力下降，诱发本病。主要发生于断奶仔猪，常突然发病、迅速死亡，且多见于体格健壮、营养良好的仔猪。在哺乳期间发生过黄白痢或正在发生严重腹泻的仔猪，一般不发生水肿病。
防治措施包括：防止饲喂过饱；适时补硒（铁硒双效针肌注或添加硒制剂）；免疫预防：灭活苗、弱毒苗、基因工程苗；治疗：抗菌消炎、解毒强心、利尿消肿。可用卡那霉素、硫酸新霉素或硫酸链霉素，每天2次，连续注射2～3天。利用分离的病原菌制备高免血清，给仔猪口服或注射，可用于预防或紧急治疗。
猪水肿病目前尚无特效治疗方法，因此做好饲养管理是预防的关键。坚持自繁自养是首要条件，避免从疫区引进新猪。如果附近猪场有发病情况，需加强卫生和免疫工作。断奶仔猪饲料中应加入适当抗菌药物，合理搭配营养物质，增强仔猪抗病能力，避免突然更换饲料。在饲料中加入盐类泻剂连用2天，或使用亚硒酸钠和维生素E，可有效预防本病。