水稻在抽穗率达到20%开始进行授粉工作。当晴天的温度处于25℃-30℃时，授粉时间为上午11点半至下午1点；阴天气温较低时，授粉时间在上午12点半至下午1点。从抽穗开始授粉到授粉结束，一般持续7-10天。水稻抽穗开花最适宜的温度为25-30℃，20℃以下的低温无法完成受精过程，导致谷粒形成空壳；35℃以上高温同样对受精不利，空壳率会大量增加。
湿度和风速对水稻授粉成功也有影响。开花受精最适宜的湿度为70-80%，气候太干燥不利于受精，容易形成空壳；但开花期间大雨或连日阴雨，湿度过大也会影响受精和结实，形成空秕粒。
水稻授粉期间可以喷施杀菌剂，但应严格掌握用量，不盲目增加。上午9-11时是水稻开花最旺盛时段，此时施药容易伤害花器，因此喷施农药应在上午8、9点之前或下午3、4点之后进行。开花时期喷施农药应选择高效、安全、低毒、低残留的品种，严禁使用禁用农药，以防稻谷内农药含量超标污染水稻，损害人体健康。此外，花期刚抽出的稻穗组织幼嫩，抗药剂能力弱，喷施农药时必须严格把握剂量和浓度，防止发生药害。