绵腐病是水稻秧苗期常见的一种真菌性病害，主要发生在3叶期前以及长期淹水的湿润苗床。病菌多存在于污水中，水稻播种后开始侵染幼芽，7天左右出现症状。发病初期在颖壳破口或幼芽基处产生乳白色胶状物，随后向四周放射长出白色絮状菌丝体或导致幼芽枯死。秧田初期一般只有部分叶片被感染，若遇低温绵雨或厢面长期淹水，病害会迅速扩散。
播种后若遇低于10°C的低温，秧苗根系活力减退，吸水吸肥能力下降，导致根系生长缓慢，抗性降低，使病菌侵染秧苗，造成烂秧。秧苗3叶期前后，气温越低，发病持续时间越长。
防治绵腐病时，可在育秧播种后至现芽前保持秧田厢面湿润，避免过早上水到厢面，遇低温雨天需灌水护芽。秧苗1叶展开后可适当灌浅水，2-3叶期以保温防寒为主，浅水勤灌。发病初期可喷施75%敌克松800倍液、30%土菌500倍液、72%普力克700倍液或47%加瑞农800倍液等药剂，雨季一般隔10天使用1次，连续3次。播种前可用敌克松进行苗床消毒，发现中心病株后及时施药防治，可亩用25%甲霜灵可湿性粉剂800-1000倍液、65%敌克松可湿性粉剂700倍液或硫酸铜1000倍液均匀喷施。绵腐病严重时，秧田需换清水2-3次后再施药，还可亩撒施草木灰15-25公斤。
种植水稻时应选择排水性良好的土壤，避免种植在排水不良或粘重板结的土壤中，以防根系生长不良。温暖天气时需适量浇水，避免植株长期泡水，减少绵腐病感染风险。