可利用不同的蔬菜作物对养分的需求以及病虫害抗性的差异性,进行合理的轮作、间作、套作、混作,能减轻土壤障害,降低土传病害发生的几率。在生产瓜果的过程中,可插入一茬葱蒜类或豆科作物,因为葱蒜类作物所残留的大蒜素能抑制或杀灭一些土传病害,而豆科作物根瘤菌所具有的固氮作用,能够培肥土壤。茄子间种大葱韭菜能够防治蚂蚁,大蒜与棉花间作能够驱避棉蚜,番茄和甘蓝间作能驱避甘蓝害虫,韭菜和大白菜间作能防治大白菜软腐病,洋葱和豌豆间作能防治豌豆黑斑病。针对土壤里某种盐分含量超过0.2%的菜地,可合理进行大水漫灌,将盐分冲洗掉。当盐害严重时可采用生物脱盐的方法,即停种一年蔬菜,改种一茬吸盐植物。将土壤深翻35-40cm,能破除土壤板结,提高土壤的通透性,改善土壤理化性状,消除土壤连作障害。一般结合深翻整地使用棉隆颗粒剂进行化学消毒,也能有效降低连作障害发生的几率。