大棚栽植辣椒落花落果是发生极为普遍的问题，一般落花率可达40%―50%，落果可达10%―20%，减轻落花落果对提高辣椒的产量具有极为重要的意义。落花落果的原因很多，但综合起来，主要表现为营养不良、不利的气候条件和病虫危害而造成。
1.营养不良
由于栽培管理措施不利，如栽培密度过大或氮肥施用过多，造成植株徒长，营养生长和生殖生长失去平衡，使辣椒花、果营养不足而脱落。大棚栽培中，辣椒较易徒长，因此落花落果是常见的现象。
2.不利的气候条件
冬春季大棚中经常遇到光照不足，温度偏低(低于15℃)的天气，影响授粉，即使授粉，果实也发育不良，易脱落，这在阴雨雪天气时表现更突出。春末夏初及秋初，大棚内经常出现35℃以上的高温，可使辣椒花器发育不全或柱头干枯，不能授粉而落花。大棚内通风不良，湿度过大时，造成辣椒花不能正常散粉，使授粉受精难以完成而造成落花落果。辣椒怕涝，田间积水数小时就可使根系窒息，叶片黄化脱落，植株落花落果，重者整株死亡。
3.病虫危害
辣椒发病后，如发生病毒病症、炭疽病、叶枯病等，也易引起落花落果。如感染病毒病后，常出现死顶现象，造成落花落果；烟青虫、棉铃虫蛀果；也易脱落。
防止落花落果应从加强栽培管理入手，主要是培育壮苗，适时定植，合理密植、科学施肥。定植后加强通风排湿，棚内白天温度保持25―28℃，夜间15―18℃，开化期最低为15℃。棚内提倡膜下灌水，勿大水漫灌。通过科学的栽培管理，提高植株的抗逆能力，注意病虫害防治。除上述措施外，可用40―5Oppm的番茄灵、5Oppm奈乙酸喷、浸花，或用20―3Oppm的2，4一D涂抹花柄。