温度是种蛋孵化的首要条件。胚胎只有在适宜、均匀的温度下才能健康地生长发育，从而创造理想的孵化成绩。若温度偏高，则胚胎发育过速，提前出雏，胚胎死亡率增加(死亡的多少视温度超标幅度大小及高温持续时间长短而异)。如：孵化温度超过42℃时(107.6F)胚胎经2～3小时死亡;孵化温度47℃(116.6F)，5胚龄的鸡胚2小时全部死亡，16胚龄的鸡胚半小时死亡。如温度偏低，胚胎发育迟缓，出雏时间落后，死亡增多。如果孵化温度长期停留在35.6℃(96F)，则大多数胚胎不能出壳。若偏离最适宜的温度幅度较小，对10胚龄以后尤其是孵化后期的鸡胚影响较小(因为此时鸡胚的调温能力和对外界的抵抗力逐渐增强)，而对1～10胚龄的胚胎依然影响较大。
孵化车间室温的恒定
冬季室温低于5℃时，会导致供热系统的供热时间延长，电热器附近温度偏高，胚胎发育过速;而孵化机进气孔附近或者扇风不匀造成冷气留滞的地方，则温度偏低，胚胎发育慢，导致出雏不齐，病弱雏增多，孵化成绩下降。夏季室温高于35℃时，对14胚龄前的胚胎影响不大，而14胚龄后的胚胎有了较强的产热能力，易产生超温现象。导致中后期死亡率增高。所以要采取措施尽力维持室温恒定在一个较合适的温度。孵化室的温度最好为20～22℃，相对湿度55%～60%。但在移盘或照蛋时，室温应提高到23～26℃。
冬季温度过低时可在孵化室内增加热源，提高室温。在炎热的夏季，在不用供热器供热后，孵化箱门表所示温度仍然超标的情况下，应打开箱门散发余热(两边箱门应同时开启，而敞开的空隙要按超温的多少而定，最好是一样大小)。如果孵化箱内温度仍然偏高，可在室内适当安装排风扇、吊扇，加大室内通风量，或采取湿帘降温、地面喷水等措施，有条件的可安装空调。
正确运用孵化温度
孵化用温方案
有两种方法，即变温孵化和恒温孵化。两种不同的给温方式，一定程度上都可以获得很高的孵化率。实践证明，变温孵化如运用得当，孵出的雏鸡比较健壮，用手握雏鸡时，挣扎力强，骨架较硬，肌肉富有弹性，雏鸡反应灵敏，抵抗力强，成活率较高。这些特点用恒温孵化则次之。究其原因，主要是因为变温孵化，胚胎经过高温的考验，剔除了部分弱雏，尤其是变温孵化根据鸡胚日龄不同区别给温，利于胚胎生长发育。
①变温孵化
首批入孵时首先参照用温方案给温，以后每隔3天随机抽检一次入孵蛋，看其发育情况是否与鸡胚发育标准一致，做到心中有数。如果胚胎发育偏慢或偏快，应及时调整孵化温度。经1～2批试孵后，若出雏率高而雏鸡品质良好，则可确定本机给温方案是正确的。
②恒温孵化
经试验，鸡胚发育对温度有一定适应能力，其温度范围是37℃～39℃(98.6F～103F)，而最适宜的温度是37.8℃(100F)。
恒温孵化是将入孵的种蛋大体分为两个阶段孵化：一般是1～19天100F(37.8℃)，20～21天98.6～99F(37～37.2℃)，两个阶段均用恒温孵化。但必须把孵化室的温度恒定在71.6～78.8F(22～26℃)。
掌握孵化温度应注意的问题
(1)必须根据本场的实际情况制定科学合理的施温方案，并经本场试验后方可使用。未经本场试验的孵化用温制度，千万不能大批量使用。
(2)无论采用哪一种用温方案，都要根据实际情况灵活掌握。冬季应适当提高温度;夏天则应适当降低。出雏后期应酌情提高出雏器的温度1～2F为宜。在实际工作中应定期抽检，发现胚胎不符合标准时，应立即采取补救措施。
(3)分批入孵时，新入孵种蛋的蛋盘要与原来的蛋盘间隔放置，这样的好处有三点：孵化箱内温度均匀，胚胎发育整齐;新入孵的种蛋升温较快;蛋架两边重量平衡，便于翻蛋。
(4)开机后4～5小时要达到适宜温度。时间过长或过短对鸡胚发育均会产生不利的影响。为使升温时间适宜，可采取种蛋入孵前预热、酌情关闭通气孔、提高室温等措施。