牛口蹄疫的主要病理变化是口蹄与毛边界处长水泡。
剖检可见心肌出现淡黄色或灰白色、带状或点状条纹，似如虎皮。
食管和前胃粘膜上见到水疱和烂斑。在幼畜，主要是心肌炎变化，表现为不规则的灰黄色至灰白色纹斑点（“虎斑心”）。
除了口腔和蹄部，还可见食道和瘤胃粘膜有水泡和烂斑，胃肠有出血炎症，肺呈浆液性侵润，心包有大量混浊液体，恶性口蹄疫可见心机切面灰白色或淡黄色条纹，成为虎斑心。
口腔溃疡，舌面有烂斑，有时牛鼻镜上也有水泡和烂斑，蹄叉、蹄甲与肌肤周围连结处出现水泡和溃疡，乳腺同样出现水泡和溃疡，幼畜常见心肌炎，呈“虎斑心”。
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