及时排水，降低土壤湿度，并喷施碧护＋海藻酸（或腐植酸、氨基酸叶面肥），以促进幼苗恢复生长，增强植株的抗逆能力和抗病能力，促根壮苗。田间受到水淹时，湿度会快速上升，有利于杂草生长和病虫害传播，因此喷施叶面肥时还需防治杂草和病虫害。大小斑病可使用百菌清、甲基托布津防治，纹枯病可使用井冈霉素、多菌灵防治，每隔7-10天用药1次，连用2-3次。若玉米苗受淹后发黄，每亩地可叶面喷施45-60公斤0.2-0.3%磷酸二氢钾＋1%尿素溶液，每隔7-10天喷1次，连喷2-3次。及时中耕，增强土壤通透性，避免严重板结，改善玉米根系生长环境。若受损严重，可耕翻补种。
玉米苗耐寒性不强，气温低于8℃且持续3-4天，幼苗会死亡或烂种；低温持续5-6天，死苗率达30-40%；超过7天，死苗率达60%。玉米属喜温作物，种子发芽要求最低温度6-10℃，低于10℃发芽缓慢；16-21℃发芽旺盛，适温28-35℃，高于40℃停止发芽。拔节期要求温度15-27℃，开花期25-26℃，灌浆期20-24℃。建议选择抗寒性强的玉米品种，种植期间适当保温，苗期可覆盖地膜，平时将温度控制在15-27℃。